鹿島神社のある鹿島は、かつては港内の瓢箪形の小島で、全体を境内としていましたが、昭和40年（1965）に鹿島公園の造成で旭町と陸続きになり現在に至っています。

祭神は武甕たけみか槌尊づちのみことで、境内に未社の香取宮があり、大正5年（1916）には清水地区にあった天満宮（天神さん）と大山神社（山の神さん）などを合祭しています。

境内社叢には、樹高15mのイヌマキやシイ・タブなどの大樹があり、豊かな植物が繁っているほか、テンナンショウなど土佐清水では希な植物が残っているので特に貴重と言われています。